Han ska ha blivit kallad för n-ordet av Pachucas kapten Gustavo Cabral.
Fifa utreder nu händelsen.
Real vann matchen trots att de spelade med en man mindre.
Redan i den sjunde minuten fick mittbacken Raúl Asencio syna det röda kortet.
Trots det gick Real Madrid upp i 2–0 ledning i första halvlek genom mål av Jude Bellingham och Arda Güler.
I minut 70 utökade Federico Valverde till 3–0.
Med drygt tio minuter kvar av ordinarie speltid reducerade Elias Montiel till 1–3. Men Real Madrids tio man kunde hålla undan och vann matchen.
Det är Real Madrids nyblivne tränare Xabi Alonsos första seger som huvudtränare för klubben.