Magiera ingick i förbundskapten Jan Urbans stab när Polen ställdes mot Sverige i VM-playoff för tio dagar sedan.
”PZPN framför sina djupaste kondoleanser till Jacek Magieras familj, vänner och anhöriga”, skriver det polska förbundet i ett uttalande.
Enligt rapporter från Radio Wroclaw kollapsade Magiera under en löptur på fredagsmorgonen. Han fördes till sjukhus, där han senare avled.
Före sin tränarkarriär hade Magiera en framgångsrik spelarkarriär, med triumfer i Legia Warsawa.